آپریل اونیل، گزارشگر تلویزیونی بخش خبری شاهدان عینی "کانال 6" نیویورک است که بررسی موج جرم و جنایت به راه افتاده توسط گروهی جنایتکار مسلح موسوم به "دار و دسته ی پا" می پردازد. او یک شب که با دوچرخه و به تنهایی به اسکله رفته شاهد حضور تعدادی از افراد "دار و دسته ی پا" برای حمل محموله ای قاچاق است که ناگهان شخص یا اشخاصی ناشناس آنها را را مورد حمله قرار داده و از اسکله فراری می دهد. آپریل تنها مدرکی از افراد مهاجم پیدا می کند نشان یا لگوی آنهاست که بر روی یکی از کانتینرها حک شده است. او از نشان مهاجمین عکس می گیرد و فردای آن روز به سراغ سرپرست بخش خبری برناردت تامپسون می رود اما با بی اعتنایی او و همکارانش رو به رو می شود. سپس آپریل در حالی که به پوشش یک رویداد خیریه توسط صنایع ساکس رفته با دوست قدیمی پدرش اریک ساکس مواجه می شود. شرایدر رهبر "دار و دسته ی پا" که از تار و مار شدن افرادش در اسکله و تمسخر آنها از سوی مردم به خشم آمده برای به چنگ آوردن مهاجمین به افرادش دستور می دهد تا دست به  گروگان گیری در مترو بزنند. گروگان گیرها در ازای آزادی گروگان ها خواهان تسلیم مهاجمین شب گذشته در اسکله می شوند در حالی که آپریل هم جزو یکی از گروگان هاست. اما ناگهان چهار چهره ی مرموز به سرعت از راه می رسند و افراد مسلح را خلع سلاح کرده و گروگان ها را آزاد می کنند. آپریل به دنبال آنها به پشت بام ساختمانی بلند می رود و با چهار لاک پشت جهش یافته ی انسان نما رو به رو می شود و پنهانی با موبایلش از آنها عکس می گیرد. لاک پشت ها آپریل را گیر می اندازند و او که ترسیده از هوش می رود. وقتی دوباره او به هوش می آیدف تصاویر بر روی موبایلش پاک شده و لاک پشت ها از او می خواهند که در مورد آنها با کسی صحبت نکند. آنها انجا به سرعت و جست و خیزکنان ترک می کنند و آپریل از میان صحبت های آنها نام دو تن از آنها به نام لئوناردو و رافائل را می شنود. او به خانه اش بازمی گردد و به یاد پروژه ی کاری پدرش در سال 1999 می افتد: "پروژه ی رنسانس"، شامل چهار لاک پشت کوچک به نام های لئوناردوف رافائل، میکل آنجلو و دوناتلوف و یک موش به نام اسپلینتر. او فیلم و تصاویر لاک پشت ها را پیدا می کند و اما باز هم نمی تواند برنادت را قانع کند و اخراج می شود. همکار او ورنون فِنویک او را به املاک ساکس می رساند تا او با تنها کسی که او را دیوانه نمی پندارد و حرف های او را باور می کند صحبت کند. اریک ساکس معتقد است که با پیدا کردن لاک پشت ها می توان خدمت بزرگی به بشریت کرد. لاک پشت ها پس از بازگشت به پناهگاه شان در زیر زمین و در تونل های تو در توی فاضلاب توسط اسپلینتر - که نقش بزرگ تر و پدر آنها را بازی می کند- به جرم نافرمانی تنبیه می شوند. او به لاک پشت ها دستور می دهد که آپریل پیدا کرده و به آنجا بیاورند. او برای آپریل توضیح می دهد که چگونه آزمایشگاه اتش گرفت اما آپریل که آن زمان دخترکی کم سن و سال بود آنها نجات داده و سپس آزادشان کرده است، و حالا آنها مدیون او هستند. او توضیح می دهد که آنها به وسیله ی ماده ی جش زایی که در بدن شان بوده خیلی زود رشد کرده اند به ویژگی های انسانی دست یافته اند. سپس اسپلینتر نقش پدر لاک پشت ها را بر عهده گرفته، خودش پس از پیدا کردن کتاب نینجوتسو به آموزش هنرهای رزمی می پردازد و سپس لاک پشت های نوجوانش را تعلیم و آموزش می دهد. او به آپریل می گوید که ساکس فرد قابل اعتمادی نیست و دستش در دست شرایدرِ شیطان صفت است و او کسی اشت که به پدرش خیانت کرده. آپریل اتمام صحبت های اسپلینتر کارت ویزیتی را که ساکس به او داده از جیبش بیرون می آورد، کارتی که مجهز به یک تراشه ی ردیاب است. ناگهان آنها با حمله ی افراد ساکس و شرایدر رو به رو می شوند که از همه سو به پناهگاه آنها حمله ور می شوند.....