او در رشته کارگردانی سینما در دانشکده هنرهای دراماتیک تهران (دانشکده سینما و تئاتر دانشگاه هنر) تحصیل کرد. وی از سال 1352 با سمت منشی صحنه در تلویزیون مشغول به کار شد و تا سال 1359 چند فیلم مستند کوتاه را کارگردانی کرد. فعالیت سینمایی خود را از سال 1360 به عنوان منشی صحنه فیلم «آفتاب نشین ها» و فیلم «گل های داوودی» آغاز کرد. بنی اعتماد با جهانگیر کوثری (تهیه‌کننده و مفسر و گزارشگر فوتبال) ازدواج کرده‌ است و دخترشان، باران کوثری است. حسین عالمگیر نویسنده کتاب «باران کوثری در سینمای ایران» درباره شخصیت رخشان بنی اعتماد در کتاب خود اینچنین می‌گوید: "او را نمی‌توان صرفاً یک کارگردان دانست بهتر است بگوییم کارگردانی او بخشی کوچک از فلسفه‌ای تفکر بنی اعتماد است تا بدین وسیله ابعاد فکری خود را در قالب فیلم طرح نماید. بنی اعتماد نمونه یک زن ایرانی ست. زنی که می‌گوید زنان ایرانی اگر فرصت و مجال هنر نمایی داشته باشند ابرهایی می‌شوند که باران‌ها در دامانشان متولد می‌شود."