او در سال ١٩٦٣ به استودیوی تولید فیلم توئی پیوست. در این استودیو، میازاکی به پیشرفت کاریِ خارق‌العاده‌ای دست یافت و از آن پس به عنوان طراح در سریال‌های مختلف انیمیشنی دعوت به کار شد. از جمله این انیمیشن‌ها می توان به مجوعه «هایدی» (1974)، اشاره کرد.
در سال ١٩٧٩ با نوشتن فیلم «قصر کاگلیوستر»، رویای فیلمنامه‌نویسی او به حقیقت پیوست. در آغاز سال‌های دهه ١٩٨٠ با فیلمنامه‌نویسی کارتون «مانگا و ناوزیکائه»، که داستان تلاش دختری ست برای ادامه زندگی در دنیایی عجیب و نامهربان، او بزرگترین پروژه فیلم کارتونی خود را به انجام رسانید. وی در سال ١٩٨٥ به اتفاق ایسائو تاکاماتا، استودیویی بنا نهاد که بعدها دارای شهرتی جهانی و عملا سکوی ترقی و پیشرفت حرفه‌ای برای سایر هنرمندان در زمینه‌ی پویانمایی شد. «مانگا» در سال ١٩٨٢ به اکران آمده و درست همانند « ناوزیکائه» موفقیت چشمگیری در سطح جهانی کسب کرد. درآمد حاصل از فروش این فیلم امکان تاسیس استودیوی ژیبلی و در نتیجه مکان و امکان تولید فیلم‌های سایر فیلمسازهای مستعد نیز فراهم آورد. میازاکی در کنار فیلمهای کوتاه، هفت فیلم سینمایی نیز در استودیوی ژیبیل تولید کرد. و با همین رویداد، او یکی از مهمترین نمایندگان تولید انیمیشنهای ژاپنی شد.